超越地球轨道的人类空间勘探将涉及大量距离和持续时间的任务。为了有效减轻无数空间健康危害,数据和空间健康系统的范式转移是实现地球独立性的,而不是Earth-Reliance所必需的。有希望在生物学和健康的人工智能和机器学习领域的发展可以解决这些需求。我们提出了一个适当的自主和智能精密空间健康系统,可以监控,汇总和评估生物医学状态;分析和预测个性化不良健康结果;适应并响应新累积的数据;并提供对其船员医务人员的个人深度空间机组人员和迭代决策支持的预防性,可操作和及时的见解。在这里,我们介绍了美国国家航空航天局组织的研讨会的建议摘要,以便在太空生物学和健康中未来的人工智能应用。在未来十年,生物监测技术,生物标志科学,航天器硬件,智能软件和简化的数据管理必须成熟,并编织成精确的空间健康系统,以使人类在深空中茁壮成长。
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空间生物学研究旨在了解太空飞行对生物的根本影响,制定支持深度空间探索的基础知识,最终生物工程航天器和栖息地稳定植物,农作物,微生物,动物和人类的生态系统,为持续的多行星寿命稳定。要提高这些目标,该领域利用了来自星空和地下模拟研究的实验,平台,数据和模型生物。由于研究扩展到低地球轨道之外,实验和平台必须是最大自主,光,敏捷和智能化,以加快知识发现。在这里,我们介绍了由美国国家航空航天局的人工智能,机器学习和建模应用程序组织的研讨会的建议摘要,这些应用程序为这些空间生物学挑战提供了关键解决方案。在未来十年中,将人工智能融入太空生物学领域将深化天空效应的生物学理解,促进预测性建模和分析,支持最大自主和可重复的实验,并有效地管理星载数据和元数据,所有目标使生活能够在深空中茁壮成长。
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There are multiple scales of abstraction from which we can describe the same image, depending on whether we are focusing on fine-grained details or a more global attribute of the image. In brain mapping, learning to automatically parse images to build representations of both small-scale features (e.g., the presence of cells or blood vessels) and global properties of an image (e.g., which brain region the image comes from) is a crucial and open challenge. However, most existing datasets and benchmarks for neuroanatomy consider only a single downstream task at a time. To bridge this gap, we introduce a new dataset, annotations, and multiple downstream tasks that provide diverse ways to readout information about brain structure and architecture from the same image. Our multi-task neuroimaging benchmark (MTNeuro) is built on volumetric, micrometer-resolution X-ray microtomography images spanning a large thalamocortical section of mouse brain, encompassing multiple cortical and subcortical regions. We generated a number of different prediction challenges and evaluated several supervised and self-supervised models for brain-region prediction and pixel-level semantic segmentation of microstructures. Our experiments not only highlight the rich heterogeneity of this dataset, but also provide insights into how self-supervised approaches can be used to learn representations that capture multiple attributes of a single image and perform well on a variety of downstream tasks. Datasets, code, and pre-trained baseline models are provided at: https://mtneuro.github.io/ .
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自动生物医学图像分析的领域至关重要地取决于算法验证的可靠和有意义的性能指标。但是,当前的度量使用通常是不明智的,并且不能反映基本的域名。在这里,我们提出了一个全面的框架,该框架指导研究人员以问题意识的方式选择绩效指标。具体而言,我们专注于生物医学图像分析问题,这些问题可以解释为图像,对象或像素级别的分类任务。该框架首先编译域兴趣 - 目标结构 - ,数据集和算法与输出问题相关的属性的属性与问题指纹相关,同时还将其映射到适当的问题类别,即图像级分类,语义分段,实例,实例细分或对象检测。然后,它指导用户选择和应用一组适当的验证指标的过程,同时使他们意识到与个人选择相关的潜在陷阱。在本文中,我们描述了指标重新加载推荐框架的当前状态,目的是从图像分析社区获得建设性的反馈。当前版本是在由60多个图像分析专家的国际联盟中开发的,将在社区驱动的优化之后公开作为用户友好的工具包提供。
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原始的“七个图案”阐述了科学计算领域的基本方法的路线图,其中图案是一种捕获计算和数据移动模式的算法方法。我们介绍了“仿真智力的九个主题”,是一种开发和整合的路线图,以合并科学计算,科学模拟和人工智能所必需的基本算法。我们称之为合并模拟智能(SI),短暂。我们认为模拟智能的主题是相互连接的和相互依存的,很像操作系统层中的组件一样。使用这种隐喻,我们探讨了模拟智能操作系统堆栈(Si-Stack)和其中图案的各层的性质:(1)多种物理和多尺度建模; (2)替代建模和仿真; (3)基于仿真的推理; (4)因果建模和推理; (5)基于代理的建模; (6)概率编程; (7)可微分的编程; (8)开放式优化; (9)机器编程。我们相信图案之间的协调努力提供了加速科学发现的巨大机会,从综合生物和气候科学中解决逆问题,指导核能实验,并预测社会经济环境中的紧急行为。我们详细说明了Si-stack的每层,详细说明了最先进的方法,提出了示例以突出挑战和机遇,并倡导具体的方法来推进主题和与其组合的协同作用。推进和整合这些技术可以实现稳健且有效的假设仿真 - 分析类型的科学方法,我们用几种使用案例为人机组合和自动化学介绍。
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尽管自动图像分析的重要性不断增加,但最近的元研究揭示了有关算法验证的主要缺陷。性能指标对于使用的自动算法的有意义,客观和透明的性能评估和验证尤其是关键,但是在使用特定的指标进行给定的图像分析任务时,对实际陷阱的关注相对较少。这些通常与(1)无视固有的度量属性,例如在存在类不平衡或小目标结构的情况下的行为,(2)无视固有的数据集属性,例如测试的非独立性案例和(3)无视指标应反映的实际生物医学领域的兴趣。该动态文档的目的是说明图像分析领域通常应用的性能指标的重要局限性。在这种情况下,它重点介绍了可以用作图像级分类,语义分割,实例分割或对象检测任务的生物医学图像分析问题。当前版本是基于由全球60多家机构的国际图像分析专家进行的关于指标的Delphi流程。
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通过最大化示例的不同转换“视图”之间的相似性来构建自我监督学习(SSL)构建表示的最先进的方法。然而,在用于创建视图的转换中没有足够的多样性,难以克服数据中的滋扰变量并构建丰富的表示。这激励了数据集本身来查找类似但不同的样本,以彼此的视图。在本文中,我们介绍了我自己的观点(MISOW),一种新的自我监督学习方法,在数据集中定义预测的不同目标。我们的方法背后的想法是主动挖掘观点,发现在网络的表示空间中的邻居中的样本,然后从一个样本的潜在表示,附近样本的表示。在展示计算机愿景中使用的基准测试中,我们突出了在神经科学的新应用中突出了这个想法的力量,其中SSL尚未应用。在测试多单元神经记录时,我们发现Myow在所有示例中表现出其他自我监督的方法(在某些情况下超过10%),并且经常超越监督的基线。通过MOSO,我们表明可以利用数据的多样性来构建丰富的观点,并在增强的新域中利用自我监督,其中包括有限或未知。
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While the brain connectivity network can inform the understanding and diagnosis of developmental dyslexia, its cause-effect relationships have not yet enough been examined. Employing electroencephalography signals and band-limited white noise stimulus at 4.8 Hz (prosodic-syllabic frequency), we measure the phase Granger causalities among channels to identify differences between dyslexic learners and controls, thereby proposing a method to calculate directional connectivity. As causal relationships run in both directions, we explore three scenarios, namely channels' activity as sources, as sinks, and in total. Our proposed method can be used for both classification and exploratory analysis. In all scenarios, we find confirmation of the established right-lateralized Theta sampling network anomaly, in line with the temporal sampling framework's assumption of oscillatory differences in the Theta and Gamma bands. Further, we show that this anomaly primarily occurs in the causal relationships of channels acting as sinks, where it is significantly more pronounced than when only total activity is observed. In the sink scenario, our classifier obtains 0.84 and 0.88 accuracy and 0.87 and 0.93 AUC for the Theta and Gamma bands, respectively.
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Logic Mill is a scalable and openly accessible software system that identifies semantically similar documents within either one domain-specific corpus or multi-domain corpora. It uses advanced Natural Language Processing (NLP) techniques to generate numerical representations of documents. Currently it leverages a large pre-trained language model to generate these document representations. The system focuses on scientific publications and patent documents and contains more than 200 million documents. It is easily accessible via a simple Application Programming Interface (API) or via a web interface. Moreover, it is continuously being updated and can be extended to text corpora from other domains. We see this system as a general-purpose tool for future research applications in the social sciences and other domains.
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In this paper we take the first steps in studying a new approach to synthesis of efficient communication schemes in multi-agent systems, trained via reinforcement learning. We combine symbolic methods with machine learning, in what is referred to as a neuro-symbolic system. The agents are not restricted to only use initial primitives: reinforcement learning is interleaved with steps to extend the current language with novel higher-level concepts, allowing generalisation and more informative communication via shorter messages. We demonstrate that this approach allow agents to converge more quickly on a small collaborative construction task.
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